1月
REMmapleさんのルカV4Xのモデルデータが投稿され、注目を集める
2月
Orangestar「Alice in 冷凍庫」が投稿され、注目を集める。また、hakusaiさんのイラストが多数投稿され注目を集める。
5~11日イベント
第67回さっぽろ雪まつりで、雪ミクの雪像を展示。イベント「SNOW MIKU 2016」も開催。また、雪ミク施策のひとつとして、2015年11月22日~2016年3月27日の期間、雪ミクラッピング市電が運行。
3月
小林オニキスさんが投稿したイラスト作品「初根ミク」が最も注目される。また、Nachokumaさんの3Dミクが投稿され、注目を集める。
3月23日~4月10日イベント
福岡・大阪・愛知(名古屋)・北海道(札幌)・東京のZeppを巡る、初の日本ライブ・ツアー「HATSUNE MIKU EXPO 2016 Japan Tour」を開催。3月14日~4月17日には、ライブ開催都市で企画展も実施。
24日ゲーム
セガゲームスよりPS VITA専用ゲームソフト「初音ミク Project DIVA X」が発売。
4月
4日機能追加
作品ページリニューアル・カードイラスト機能追加
ピアプロ公式コラボ『グッドスマイルカンパニー×ピアプロ 2017年ねんどろいど雪ミク衣装&ラビット・ユキネ衣装大募集!』開催
ピアプロ公式コラボ『「マカロンデー」チャリティーイラスト募集!』開催
2017年雪ミク衣装コラボの応募作品が複数投稿され、注目を集める。なお、この月に2017年雪ミクの受賞作品が投稿される
29、30日コラボ話題
「ニコニコ超会議」にて初音ミクが歌舞伎とコラボ。楽曲「千本桜」をもとにした「超歌舞伎 『今昔饗宴千本桜』」が公演される
6月
ピアプロ公式コラボ『2017年ピアプロカレンダーイラスト・楽曲募集!!』開催
マジカルミライ 2016のテーマソング「39みゅーじっく!」のインストが投稿され、注目を集める。
4~12日・25~26日イベント
台湾で「HATSUNE MIKU EXPO 2016 in Taiwan」を開催。6月25日~26日にNew Taipei City Exhibition Hallでライブを、6月4日~12日にHuashan Creative Parkで企画展を実施。
23日ゲーム
セガゲームスよりPS4専用ゲームソフト「初音ミク Project DIVA Future Tone」が配信
8月
初音ミク9周年お祝いイラスト、また新しく登場した「音街ウナ」の作品が投稿され注目を集める。
25日ゲーム
25日、セガゲームスよりPS4専用ゲームソフト「初音ミク Project DIVA X HD」が発売。
26日イベント
東京国際フォーラムで、初音ミクの単独フルオーケストラコンサート「初音ミクシンフォニー」を開催。
31日新ボーカロイド
「初音ミク V4X」発売
9月
ピアプロ公式コラボ『ハッカドール×初音ミク ハッカドール39号衣装デザイン案大募集!』開催
yasuくんさんの「 少女∀」が最も注目を集める。また、歌詞作品が多数投稿される。
イベント
千葉・幕張メッセの国際展示場で、イベント『初音ミク「マジカルミライ 2016」』を開催。9月10日~11日にライブを、9月9日~11日に企画展を実施。
10月
バルーン「シャルル」と、北海道コラボの受賞作品が注目される。
27日新ボーカロイド
「VOCALOID4 東北ずん子」発売
11月
MEIKOの発売記念日という事で、MEIKO作品が注目を集める。
5日コラボ話題
東京・Bunkamuraオーチャードホールで開催した「冨田勲 追悼特別公演 冨田勲×初音ミク『ドクター・コッペリウス』」に初音ミクが出演。オーケストラとシンセサイザー、そして生身のダンサーとバレエで共演。
12月
ピアプロ公式コラボ『piaproを盛り上げよう第2弾!4コママンガ&アイコンイラスト募集!』開催
ピアプロ9周年、鏡音リン・レン9周年、クリスマスイラストが投稿され注目を集める。
3、4日・10、11日イベント話題
中国の上海・北京を巡る、中国大陸ツアー「HATSUNE MIKU EXPO 2016 China Tour」を開催。
15日新ボーカロイド
「VOCALOID4 マクネナナ」発売